Historien om Seinen begyndte længe før Paris eksisterede. I romertiden bosatte Parisii-stammen sig langs dens bredder og lagde grunden til det, der skulle blive Lutetia, det gamle navn for Paris. Da handelen blomstrede, blev Seinen en vigtig pulsåre for transport af varer, mennesker og ideer, hvilket gjorde Paris til et blomstrende kommercielt knudepunkt.
Gennem middelalderen og ind i renæssancen fortsatte Seinen med at fungere som Paris' centrale rute for handel, rejser og udvikling. Kunstnere og forfattere hentede endeløs inspiration fra dens strøm. Og under mørkere kapitler som den franske revolution og verdenskrigene var floden et tavst vidne til både triumf og tragedie.
